Ce resort a créé une base de données de la population de raies mantas des récifs coraliens et des eaux alentour présentes sur Raja Ampat. Les hôtes peuvent s’impliquer dans la collecte et l’authentification des photos, et apprendre sur ces créatures et les menaces qui pèsent sur leur environnement. Le projet utilise également des sondes sonores qui permettent d’écouter et suivre les mouvements des raies mantas dans la zone protégée du Sanctuaire et même au-delà (sachant qu’elles peuvent s’éloigner à plus de 600km), les zones d’habitat critique et les routes migratoires. De plus, et avec l’aide de WildAid et Seacology, Misool Eco Resort a mis sur pied, deux projets communautaires, un à Fafanlap et un à Usaha Jaya où sont construits un jardin d’enfant, un centre communautaire, un marché et un système de purification d’eau potable.

Le Misool Eco Resort se consacre dans les écoles locales à la sensibilisation de la protection de la vie sauvage. Ils ont commencé par une librairie flottante qui apporte des livres sur la conservation des ressources marines aux enfants. A ce jour, cela a évolué en deux librairies permanentes et en un programme qui emploie six professeurs à temps plein. Le Misool Eco Resort, en collaboration avec Shark Savers et le soutien des gouvernements de Palau, des Maldives et d’Hawaii, organise une pétition pour transformer Raja Ampat en un sanctuaire pour requins et raies mantas. Ensemble, leur plus belle concrétisation a été de convaincre les chefs de villages locaux de mettre à l’amende quiconque pêche dans cette zone. Cette action pourrait mener à une loi régionale interdisant de pêcher des requins et des raies mantas. Selon les recherches de Mark Allen, un expert en pêche de l’Université de Murdoch, depuis 2007, la biomasse de poissons a triplé dans la zone du Misool Eco Resort.